מדינת ישראל ידעה אישים רבים שתרמו לביטחונה ולקיומה, אולם מעטים האנשים שתרומתם המזוקקת הייתה כה ייחודית, עד שנשמר להם מקום של כבוד בפנתיאון החשאי של גיבורי ישראל. יצחק אילן הוא מהבודדים הראויים לכך.

"הגרוזיני", כפי שכינו אותו בשב"כ, עלה מגיאורגיה כנער, למד עברית

ואחר־כך ערבית, ושירת בשב"כ בשורת תפקידים שבהם עסק באופן ישיר בסוגיות קריטיות לביטחון ישראל ולחיי אזרחיה. אילן היה מעורב בפרשיות רבות שרק מקצתן הגיעו לידיעת הציבור, וסייע לפענח ולפצח מקרים שנחשבו בלתי פתירים.

החוקר הוא סיפור חייו של אילן, ובמידה רבה סיפורה של מדינת ישראל. הוא מביא הצצה נדירה לא רק אל חייו של אילן, אלא גם לסיפורים העלומים של תפקיד חייו – חוקר שב"כ. מחקירת המרגלים מרקוס קלינגברג ושבתאי קלמנוביץ', דרך חיסולו של המהנדס יחיא עיאש והמאבק הסיזיפי בטרור הפלסטיני באינתיפאדה השנייה ובמבצע חומת מגן, ועד לפרשת רון ארד, פרשות של אסירי איקס, פרשת רצח תאיר ראדה, והתפקיד המרכזי שמילא אילן בתהליך שהוביל לזיכויו של רומן זדורוב.

החוקר כולל סיפורים ופרשות שלא נחשפו מעולם, מפיהם של מי שהיו שותפים להם בזמן אמת: אנשי השב"כ – רכזים, דסקאים, חוקרים ואנשי מבצעים — שנושאים על גבם בחשאי את מלאכת השמירה על ביטחון המדינה.